La Presidencia es el cargo de mayor rango de CEA, siendo funciones del presidente/a liderar la Asamblea General, la Junta Directiva y el Comité Ejecutivo, -los máximos órganos de representación y decisión de la Confederación-, así como representar a la organización velando por el cumplimiento de su función social al servicio de las empresas andaluzas. El presidente/a es elegido por la Asamblea General para un mandato de cuatro años, sujeto a la posible reelección.

Desde enero de 2014, y tras sendas reelecciones por aclamación en 2018 y 2022, el presidente de CEA es Javier González de Lara y Sarria (Málaga, 1963). Licenciado en Derecho por la Universidad de Málaga (UMA) es abogado en ejercicio y máster en Mediación y Resolución Extrajudicial de Conflictos. También empresario de los sectores financiero, turístico y cultural, y nacido en una familia emprendedora, en su juventud estuvo al frente del negocio familiar dedicado al comercio.

González de Lara es también vicepresidente de la Confederación Española de Organizaciones Empresariales (CEOE) y su coordinador de Acción Territorial. Igualmente preside la Confederación de Empresarios de Málaga (CEM); la Fundación CEM, Cultura, Economía y Medio Ambiente, y la Sociedad de Garantía Recíproca GARÁNTIA, en apoyo a la financiación de pymes y autónomos en Andalucía

Medalla de Oro del Consejo Andaluz de Relaciones Laborales (2006) por su dilatada trayectoria en el ámbito de las Relaciones Laborales y por su contribución al Diálogo Social en la provincia de Málaga, es también Medalla de Honor del Colegio de Abogados de Málaga (2018) y Embajador de la Marca Ejército Español (2021). Desde marzo de 2024, es miembro de la Academia de Ciencias Sociales y Medio Ambiente de Andalucía.